MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 109576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
2	NC_002755	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839373
3	NC_002755	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
4	NC_002755	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
5	NC_002755	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839373
6	NC_002755	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
7	NC_002755	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
8	NC_002755	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
9	NC_002755	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	15839373
10	NC_002755	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
11	NC_002755	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
12	NC_002755	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
13	NC_002755	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839373
14	NC_002755	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	15839373
15	NC_002755	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
16	NC_002755	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	15839373
17	NC_002755	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	15839373
18	NC_002755	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	15839373
19	NC_002755	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839373
20	NC_002755	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
21	NC_002755	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839373
22	NC_002755	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839373
23	NC_002755	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	15839373
24	NC_002755	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	15839373
25	NC_002755	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
26	NC_002755	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
27	NC_002755	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
28	NC_002755	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
29	NC_002755	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	15839373
30	NC_002755	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839373
31	NC_002755	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
32	NC_002755	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	15839373
33	NC_002755	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
34	NC_002755	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002755	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002755	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002755	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002755	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002755	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002755	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002755	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_002755	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002755	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002755	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002755	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002755	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002755	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002755	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	15839374
49	NC_002755	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	15839374
50	NC_002755	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	15839374
51	NC_002755	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15839374
52	NC_002755	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
53	NC_002755	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
54	NC_002755	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
55	NC_002755	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
56	NC_002755	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
57	NC_002755	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15839374
58	NC_002755	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	15839374
59	NC_002755	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
60	NC_002755	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
61	NC_002755	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839374
62	NC_002755	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839374
63	NC_002755	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
64	NC_002755	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839374
65	NC_002755	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	15839374
66	NC_002755	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
67	NC_002755	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839374
68	NC_002755	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	15839374
69	NC_002755	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839374
70	NC_002755	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	15839374
71	NC_002755	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839374
72	NC_002755	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
73	NC_002755	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	15839374
74	NC_002755	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	15839374
75	NC_002755	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839374
76	NC_002755	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	15839374
77	NC_002755	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	15839375
78	NC_002755	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
79	NC_002755	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
80	NC_002755	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	15839375
81	NC_002755	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
82	NC_002755	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
83	NC_002755	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839375
84	NC_002755	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839375
85	NC_002755	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
86	NC_002755	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	15839375
87	NC_002755	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
88	NC_002755	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839375
89	NC_002755	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	15839375
90	NC_002755	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
91	NC_002755	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	15839375
92	NC_002755	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839375
93	NC_002755	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
94	NC_002755	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
95	NC_002755	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
96	NC_002755	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
97	NC_002755	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
98	NC_002755	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
99	NC_002755	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
100	NC_002755	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
101	NC_002755	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
102	NC_002755	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839375
103	NC_002755	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839375
104	NC_002755	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
105	NC_002755	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839376
106	NC_002755	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	15839376
107	NC_002755	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	15839376
108	NC_002755	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839376
109	NC_002755	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839376
110	NC_002755	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839376
111	NC_002755	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839376
112	NC_002755	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839376
113	NC_002755	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839376
114	NC_002755	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	15839376
115	NC_002755	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002755	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002755	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002755	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002755	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839377
120	NC_002755	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839377
121	NC_002755	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
122	NC_002755	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
123	NC_002755	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
124	NC_002755	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
125	NC_002755	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	15839377
126	NC_002755	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	15839377
127	NC_002755	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
128	NC_002755	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
129	NC_002755	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
130	NC_002755	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15839377
131	NC_002755	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
132	NC_002755	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	15839377
133	NC_002755	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839377
134	NC_002755	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	15839377
135	NC_002755	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839377
136	NC_002755	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
137	NC_002755	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
138	NC_002755	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
139	NC_002755	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
140	NC_002755	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
141	NC_002755	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	15839377
142	NC_002755	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
143	NC_002755	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15839377
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145	NC_002755	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
146	NC_002755	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	15839377
147	NC_002755	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839377
148	NC_002755	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	15839377
149	NC_002755	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839377
150	NC_002755	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
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152	NC_002755	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839377
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154	NC_002755	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
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156	NC_002755	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839377
157	NC_002755	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839377
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159	NC_002755	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
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162	NC_002755	CG	3	6	7210	7215	0 %	0 %	50 %	50 %	15839377
163	NC_002755	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	15839378
164	NC_002755	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839378
165	NC_002755	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
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171	NC_002755	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839378
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200	NC_002755	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839378
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232	NC_002755	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_002755	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_002755	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_002755	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_002755	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_002755	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_002755	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_002755	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
262	NC_002755	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_002755	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_002755	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_002755	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
266	NC_002755	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_002755	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	15839380
268	NC_002755	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839380
269	NC_002755	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_002755	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_002755	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_002755	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_002755	GGT	2	6	11902	11907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839381
274	NC_002755	CGA	2	6	11928	11933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839381
275	NC_002755	CCG	2	6	11962	11967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839381
276	NC_002755	GCC	2	6	11977	11982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839381
277	NC_002755	GGT	2	6	12005	12010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839381
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281	NC_002755	GGC	2	6	12108	12113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839381
282	NC_002755	CGG	2	6	12148	12153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839381
283	NC_002755	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839381
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285	NC_002755	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_002755	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_002755	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
288	NC_002755	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839382
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290	NC_002755	CGA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839382
291	NC_002755	TCA	2	6	12850	12855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839382
292	NC_002755	GGT	2	6	12986	12991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839382
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301	NC_002755	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	15839384
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304	NC_002755	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
305	NC_002755	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
306	NC_002755	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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313	NC_002755	GA	3	6	14126	14131	50 %	0 %	50 %	0 %	15839386
314	NC_002755	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	15839386
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342	NC_002755	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	15839387
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399	NC_002755	AGC	2	6	17741	17746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839389
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500	NC_002755	ATG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839392

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